Кафедра мікробіології та вірусології співпрацює з Державним науково-дослідним контрольним інститутом ветеринарних препаратів та кормових добавок (м. Львів), Вармінсько-Мазурським університетом (м. Ольштин), SLW Bіоlаb (м. Оструда, Польща).

Філіалами кафедри є Львівська і Тернопільська регіональні державні лабораторії ветеринарної медицини